一、 实验仪器与试剂
表格一:实验仪器
仪器名称 | 型号 | 生产厂家 |
低温高速离心机 | 64R | BECKMAN |
PCR 仪 | 9700 | ABI |
荧光定量 PCR 仪 | 7500 | ABI |
仪器 | 厂家 | 型号 |
小型垂直电泳槽 | Biorad | 164-8001 |
转印槽 | Biorad | Trans-Blot |
脱色摇床 | 常州澳华 | TY-80B |
电泳仪 | 上海天能 | EPS-200 |
低温高速离心机 | 64R | BECKMAN |
酶标仪 | Thermo | Thermo Scientific Microplate Reader |
表格二:试剂
试剂名称 | 厂家 |
PBS (0.01M, pH 7.4) | 自配 |
Trizol | Life Technologies |
Lv仿 | 国药集团 |
异丙醇 | 国药集团 |
乙醇 | 国药集团 |
PrimeScript® RT reagent Kit | Takara |
荧光定量试剂盒 | Takara |
二、 实验步骤
1、样本处理
4℃ 12000rpm 离心收集细胞,弃上清。PBS 清洗 1 遍后,加入 1mL Trizol 充分混匀。
2、两相分离 每个样品中加入 0.2 mL 的lv仿,盖紧管盖,剧烈振荡管体,室温静置 5min。4℃下 12000rpm
离心 15 min。离心后混合液体将分为下层的红色酚lv仿相,中间层和上层的无色的水相。RNA 全部被分配于水相中。水相的体积大约是匀浆时加入的 Trizol 试剂的 60%。
3、RNA 沉淀 将水相转移到新离心管中。加入等体积的异丙醇,水相与异丙醇混合以沉淀其中的 RNA。混匀并在室温孵育 10 min 后,4℃ 12000rpm 离心 10 min。
4、RNA 清洗 移去上清液,加入 1 mL 75%乙醇,清洗 RNA 沉淀。振荡后,4℃ 7500 rpm 离心5 min。
5、重新溶解 RNA 沉淀
去除乙醇溶液,空气中干燥 RNA 沉淀 5-10 min。溶解 RNA 时,先加入无 RNA 酶的水用枪反
复吹打几次,然后 55 到 60℃孵育 10 min。获得的 RNA 溶液保存于- 70℃。
6、反转录
1) 按下列组份配制 RT 反应液
5×PrimeScript Buffer | 5 μL |
PrimeScript® RT Enzyme Mix I | 1 μL |
Oligo dT Primer(50 μM)×1 | 1 μL |
Random 6 mers(100 μM)×1 | 1.5 μL |
Total RNA | 1 ng |
RNase Free ddH2O | Up to 25 μL |
2)反转录反应条件如下: 37℃ 15min,85℃ 5s。
3)反应结束后,将其放在冰上待用或-20℃保存。
7、荧光定量 PCR
引物设计
Gene | Forward Primer | Reverse Primer |
β-action | 5′-TTCCAGCCCTCCTTCCTG-3′ | 5′-GCCCGACTCGTCATACTCC-3′ |
BCL | 5′ -CTACCGTCGTGACTTCGC -3 | 3′-CCTATTGCCTCCGACCCT-5′ |
按下列组份配制 Realtime PCR 反应体系
SYBR Premix Ex Taq | 10 μL |
PCR Forward Primer(10μM) | 1 μL |
PCR Reverse Primer(10μM) | 1 μL |
cDNA 模板 | 1 μL |
ddH2O | 7 μL |
Total | Up to 20 μL |
用漩涡振荡器将管中溶液*混合均匀,短暂低速离心。
3)点样。将混合好的液体加入孔板中,每个样本的每个基因保证3个复孔,点完样之后将 PCR 板置于离心机中 2000rpm、2min,然后用锡箔纸将板包好,置于 4 度冰箱中备用。 4) PCR 反应
Real time PCR 仪使用 ABI7500,PCR 程序已优化 将步骤 3 中已点好样的 PCR 板置于 Realtime PCR 仪上进行 PCR 反应:首先是预变形:95℃/10min
第二步是循环反应 40 cycles : 95℃/15s; 60℃/45s(收集荧光) ;72℃/45s 第三步溶解曲线:95℃/15s; 60℃/1min ;95℃/15s
三、 结果与计算(采用 2 - △△ CT 法进行分析)
基因相对表达量
创凌生物为您提供优质的服务!