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iTRAQ(TMT)-多通量定量分析蛋白组学服务:
iTRAQ (Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation) 和 TMT(Tandem Mass Tag) 分别是由AB SCIEX和Thermo Scientific公司分别开发的、对trypsin酶解肽段进行标记的试剂盒。标记肽段通过LC-MS,能同时实现对蛋白质的鉴定和对蛋白质的相对定量分析。
iTRAQ和TMT的技术原理*一样,区别在于:(1)生产商不同;(2)分子结构稍有差异;(3)标记通量有差异。iTRAQ有4标(4-plex)和8标(8-plex)2种规格,TMT有2标(2-plex)、6标(6-plex)和10标(10-plex)等3种规格。iTRAQ/TMT标记通量多样,为实验设计提供了更多的选择性,有利于用户根据自己的样品数量,选择合适的标记方案。
iTRAQ/TMT技术的优势是能同时分析8-10组样品,实验周期短。但其不足体现在实验步骤多,系统误差较大。
iTRAQ(TMT)-多通量定量分析蛋白组学服务方案:
客户只需提供样本即可。我方负责完成后续所有实验,包括:
蛋白质提取与trypsin酶解。
酶解肽段iTRAQ/TMT标记与混合。
混合肽段HPLC分离,收集馏分。
对每个馏分进行LC-MS测试。
MS数据定性及定量分析,筛选差异表达的蛋白质。
差异表达蛋白常规生物信息学分析。
我方该服务的优势体现在:(1)样品通常分为15个馏分;(2)每个流程LC-MS测试时间为2h,共计测试15×2=30h。馏分和测试时间的增加,能显著提高蛋白质鉴定数目和蛋白质定量的准确度。